MGI与新加坡国家癌症中心合作对亚洲常见癌症进行全面基因组分析
新加坡,2023年9月15日–致力于通过智能创新构建生命科学核心工具和技术的MGI Tech Singapore Pte, Ltd.(“MGI”)近日与新加坡国家癌症中心(“NCCS”)建立研究合作关系,利用MGI的核心DNBSEQTM技术为亚洲常见癌症进行全面、多维的基因组分析。这项合作是MGI通过其创新基因平台为个体化医疗和精准肿瘤学赋能的众多例证之一。
“我们很高兴与NCCS合作,通过提供我们的DNBSEQ-G400测序仪来揭示亚洲常见癌症的独特分子基因组组成,”MGI亚太区总经理Roy Tan博士说,“这项合作关系意义重大。在过去,精准肿瘤学在美国和西欧以外的地区发展不均衡。它所依赖的海量基因组数据在非西方人群中十分稀缺。通过对不同人群中未得到很好代表的癌症类型进行更好的理解,我们期待通过为亚洲社区提供MGI生命科学核心工具,使更精准的预防、诊断和治疗成为可能,从而改善患者的治疗结果和生活质量。”
根据合作关系,MGI的DNBSEQ-G400测序仪已在NCCS的癌症发现中心(CDH)设置好,用于运行RNA-seq样本。这台通用的台式测序仪采用双流芯片系统,可以灵活支持各种不同的测序模式。得益于优化的光学和生物医学系统,从样本到报告的全基因组测序手动操作时间缩短至30分钟以下。配备嵌入式数据分析软件,它可以在37小时内以满容量完成PE150测序,为用户提供高效流畅的端到端基因组测序工作流程。
依托DNBSEQ技术,将对选定的亚洲常见癌症进行体细胞基因组景观分析,如头颈部、卵巢、乳腺、胃、结肠、肝脏、胆管、宫颈、肺、前列腺、食管和叶状肿瘤,以及亚洲血管肉瘤、淋巴瘤、罕见癌症、纤维上皮瘤和几种肿瘤细胞系。此外,DNBSEQ将作为癌症发现中心分子检测目录的一部分,以支持新加坡的癌症研究人员。
“CDH在多组学分子诊断和研究方面的专业知识与MGI最先进的高通量测序技术的结合,这项合作不仅将阐明亚洲常见癌症的机制和潜在发展,还将指导我们以更好的方式预防、诊断和治疗这些癌症,” NCCS癌症发现中心主任Jason Chan博士说,“展望未来,我们将继续与MGI合作,利用他们的尖端技术推进我们对癌症治疗药物的研究。”
今年早些时候,NCCS在《自然》杂志上发表了一篇研究文章,利用MGI的DNBSEQ技术对亚洲头颈血管肉瘤的拓扑免疫景观进行了研究。研究人员成功地使用DNBSEQ对FFPE样本进行了WGS。具体来说,所有50个文库都是基于100bp的成对端读取在MGI的超快速、高精度DNBSEQ-T7测序仪上进行测序的。通过识别来自亚洲人群的血管肉瘤的基因组、转录组和免疫景观,患有血管肉瘤的患者可能会享受到更精确的治疗策略。
除了这项合作关系之外,NCCS还计划加入DCS实验室倡议,这是MGI针对大规模领先多组学实验室的第一个项目。在该倡议下,MGI将为NCCS提供DNA测序、细胞组学和空间组学(所谓的DCS实验室)产品,这些产品结合DNBSEQ技术,可用于广泛的应用,这将有助于推动关键的肿瘤学研究,从而实现更好的预防、诊断和治疗结果。
由于低重复率和高数据利用率,MGI的DNBSEQ在对低浓度肿瘤样本或高复杂性样本(如外周血和循环肿瘤DNA)进行高深度测序和分析方面展现出巨大价值。过去,基于DNBSEQ的平台使临床医生和研究人员能够进行临床诊断和研究,根据每个患者肿瘤的特定遗传特征,准确有效地指导精准癌症医疗。此外,其成本效益有望消除另一个障碍,使精准肿瘤学成为患者和医务人员越来越可获得的选择。
关于MGI
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